In dit derde seizoen komt het persoonlijk leven van onze speurders meer aan bod. Op het einde van het vorige seizoen zien we hoe Jack Malone verneemt dat zijn vrouw naar Chicago verhuist. Hij wil bij zijn gezin zijn en geeft daarvoor zijn job op. Maar kort voor het vertrek vertelt ze hem dat zij de kinderen meeneemt, en hij niet langer welkom is. Na deze harde klap moet Jack terug zijn leven in handen nemen. Als hij kans wil maken op het hoedenrecht over zijn kinderen, moet hij eerst en vooral betaald werk hebben.
Zijn oude functie is echter ingevuld door zijn collega Vivian Johnson. De bazen passen daar al snel een mouw aan, waardoor de sfeer tussen hem en Johnson in ongezonde spanning verandert. Maar Vivian heeft andere zorgen aan haar hoofd, wat die zijn achterhalen we doorheen de verschillende afleveringen. Jack’s echtscheidingprocedure zorgt voor een van de beste afleveringen in dit seizoen (Malone vs. Malone). De man wordt afgemaakt door de advocaat van de duivel, en dan kunnen de stoppen wel eens doorslaan.
Ondertussen vinden twee andere collega’s, Martin en Samantha, meer en meer de weg naar elkaar. Hij wil hun relatie van de daken schreeuwen, zij wil het liever nog geheim houden. Haar reden is begrijpelijk want het kan vreemd overkomen als blijkt dat ze voor de tweede keer iets heeft met een van haar werkcollega’s. Het laatste teamlid Danny Taylor krijgt het moeilijk als zijn broer verdwijnt en er tijdens de zoektocht allerlei bezwarend materiaal tegen die broer gevonden wordt.
Het derde seizoen zit vol dergelijke zoektochten. Zo verdwijnt er een gevangenen spoorloos in de gevangenis, een jonge moeder is vermist nadat ze als doorgeefluik in de problemen komt met de drugsmaffia, en een postbediende moet opgespoord worden als haar vrachtwagen grotendeels leeg wordt teruggevonden. Het team leert elk slachtoffer kennen doordat ze hun doen en laten op een tijdlijn te plaatsen. Zo willen ze uiteindelijk achterhalen waar het slachtoffer zich bevindt. In al deze zaken wil het team de vermiste natuurlijk levend en welk terugvinden, alleen is dat zoals in de realiteit, niet altijd het geval. Jouw zoektocht voor de dvd-box van “Without A Trace” seizoen 3 begint in de winkel en eindigt bij je thuis.